功能强大的操作、分析软件“Quantity One”
简 介
“Quantity One”是Bio-Rad公司图像系列产品的操作和分析软件。主要用来定量和分析荧光、化学发光、放射性同位素、化学染色物标记的各种单向电泳、杂交点和条带、TCL板、酶标板、培养皿的克隆斑等。
“Quantity One”能在Windows 98、Windows 95、Windows NT 4.0、Macintosh 9500(或更高)环境下运行。窗口设计有下拉式菜单、图像工具栏、菜单操作提示栏等,界面设计十分友好、非常简单易学。
“Quantity One”的图像文件以Tiff文本格式输出,可以方便的进入其它的图像处理软件进行更深一步的图像处理和编辑。同时,分析数据可以直接转入到Micro Excel, 以报告形式排版、打印。
每套“Quantity One”软件都有相对应的进入密码(Unique Password)和软件狗(Hardware Protection keys),并附有详尽的软件操作说明书。
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Quantity One
1.“Quantity One”的运行程序 打开操作界面
输入操作指令,进行图像采集
图像初步优化
图像处理 各种功能分析
文字注解和打印格式
2.“Quantity One”的主要功能和优势 2.1“Quantity One”的图像采集功能
步骤一:自动选择仪器的配置
根据您的标记信号类型,“Quantity One”能自动选择激光波长和滤波片,使整个光路调整到适当的工作状态。
步骤二:选择扫描范围
GelDoc2000提供的最大扫描面积为25cm×26cm,您可以根据样品放置的位置和大小,任意选择所需的扫描范围。
步骤三:扫描、采集图像
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GelDoc2000的扫描、采集图像和计算机成像同步进行,您可以随时从屏幕上观察到扫描的结果。
2.2“Quantity One”的分析功能及优势 1.“Quantity One”的图像优化处理工具栏
“Quantity One”的图像处理功能主要移植于Photoshop“Quantity One”可以进行背景噪音过滤,梯度背景扣除,背景灰度调节,图像的放大和缩小,图像旋转,图像修饰等图像优化和处理工作。
2.“Quantity One”的图像分析工具栏 1〕电泳分析工具栏
电泳分析工具栏可以帮助实验者很快建立实验方法,立即得到实验结果和相关性的资料,如:分子量、相对迁移率、吸收峰的信息等,所有信息自动显示在图象上,并可对凝胶、酶标板等进行各种相关性分析。具体的功能块如下: a.自动条带检测:目前最先进的条带检测方法,避免了不同 使用者之间的差异,功能包括:
自动设置最优化的电泳条带强度、消除阴 影、弱化杂条带、过滤噪音、提高检测的 灵敏度。所有这些设置可以贮存,方便反 复使用。
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b.图像转换: 该软件采用目前最新的、最先进的图像转 换工具盒,它允许使用在进行图像转换以 前先选择和确认,这种自动转换可以进行 直线线性、对数、倒数、曲线和不对称转 换,帮助使用者很快看到最弱的条带 c.分子量计算: “Quantity One” 的分子量计算功能和 易于使用的快捷式,能自动纠正电泳微笑 现象和采用多分子量标准进行计算,保证 计算结果准确。
d.定量计算: 可以计算某一条带的绝对含量,并且可以 校正曲线资料。
e.类比分析: 自动比较样品和标准品条带的相似性。 f.相对含量分析:相对含量(浓度)分析工具可以快速选定 分析对象,进行复制、旋转、重新排列等 处理。新的报告格式允许按照排列情况打 印报告,这样就非常容易制得和使用浓度 标准
g.遗传树分析: 遗传树代表了电泳栏与栏之间的相似性, 是进行研究物种间亲缘关系远近的必备 工具。
h.差异显示分析:差异显示分析让使用者很快发现偏离正常 值的条带,常常用于mRNA和PCR扩增
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结果分析
i. 微卫星DNA分析:通过计算微卫星DNA重复次数,区分 不同的等位基因。
j. RFLP和DNA指纹分析:主要用于物种亲缘关系远近的分 析,“Quantity One”能承担单张凝胶的 RFLP和DNA指纹分析,对于多张凝胶的 复杂分析,Bio-Rad提供专门的“Diversity DatabaseTW”―RFLP分析软件 k. 蛋白质分析: 也适于蛋白质电泳的各种基本分析
2〕其它的功能和优势
a. 克隆计数: “Quantity One” 采用特有的计算方法, 对培养皿内的菌斑数目进行准确计数,并 且该软件还能分辨多色克隆和噬菌斑,计 算相对百分含量。
b. DNA点阵分析:“Quantity One”可以分析中、高密度 的DNA点阵,基点超过10,000个 c. 图形轮廓分析:该工具背景可以划任何形状,帮助用户 进行形状分析,主要用于组织切片 d. 注解工具栏: 可以使用不同颜色、字号和字体的文字在 图像上进行随意注解,方便发表之用 e. 快速指引工具栏:Bio-Rad是唯一提供屏幕快速指引的公
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司,帮助新学者快速学习使用软件。这些 快速指引包括:相对含量、分子量、克隆 计数、打印、差异显示、VNTR和遗传树 f. 自动适应用户接口:为了免去一些不常用使用者对硬件进 行设置的麻烦,该软件存有根据不同应用 编写的标准硬件设置,只需要使用者选择 需要的应用要求,软件会自动进行设置 g. 独特的用户管理系统:该软件将不同用户的实验结果分开 贮存,并且自动标上日期和时间,避免了 不同使用者交叉使用时的互相干扰,又易 于到找文件
h. 符合GLP和GMP标准:该软件符合国际GLP( Good Lab Practice)和 GMP( Good Manufacture Practice)标准,避免了不同实验者之间的 操作差异
2.3 Bio-Rad的图像系列家族和分析软件家族
“Quantity One”是Bio-Rad公司图像系列产品“Gel Doc 2000”凝胶成像系统、“Flour-s”多功能成像系统、“GS 710”光密度扫描成像系统、“Personal FX同位素成像系统”、“FX”全功能分子成像系统多平台操作和分析软件。
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“Quantity One”又是Bio-Rad公司“The Discovery SeriesTW”图像分析软件家族的基石。“The Discovery SeriesTW”家族的“Diversity DatabaseTW”―RFLP分析软件,“PDQuestTW”―双向电泳分析软件,“DNACodeTW”―序列分析软件的图像都来自“Quantity One”。
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