法律分析：
一、上海出入境通行证的办理机构：根据上海市人民政府官网显示，在上海办理出入境通行证的机构是上海市公安局出入境管理局。
二、上海出入境通行证的办理流程：
(一)网上预约：“一网通办”总门户、“随申办”APP、微信及支付宝小程序等渠道提供网上预约。
(二)窗口办理：
1、由申请人本人向全市出入境窗口提交申请材料并按规定采集指纹信息;
2、受理机构工作人员依据受理条件当场对申请材料进行审查，对申请材料齐全、符合法定形式的，出具《受理回执单》;对申请材料不齐或者不符合法定形式的，一次告知申请人需要补正的全部内容;对不属于本部门职责范围或不符合受理要求的，不予受理，并向申请人说明理由;
3、决定。审批机构进行审核，在规定时间内，作出批准或者不予批准的决定。批准的，签发证件;不予批准的，向申请人出具《不予批准决定书》;
4、取证。申请人到发证窗口领取出入境证件，或者根据申请人要求通过物流快递方式送达。
法律依据：
《中华人民共和国传染病防治法》
第五条 各级人民政府领导传染病防治工作。县级以上人民政府制定传染病防治规划并组织实施，建立健全传染病防治的疾病预防控制、医疗救治和监督管理体系。
第十七条 国家建立传染病监测制度。国务院卫生行政部门制定国家传染病监测规划和方案。省、自治区、直辖市人民政府卫生行政部门根据国家传染病监测规划和方案，制定本行政区域的传染病监测计划和工作方案。各级疾病预防控制机构对传染病的发生、流行以及影响其发生、流行的因素，进行监测；对国外发生、国内尚未发生的传染病或者国内新发生的传染病，进行监测。
第十八条 各级疾病预防控制机构在传染病预防控制中履行下列职责：
（一）实施传染病预防控制规划、计划和方案；
（二）收集、分析和报告传染病监测信息，预测传染病的发生、流行趋势；
（三）开展对传染病疫情和突发公共卫生事件的流行病学调查、现场处理及其效果评价；
（四）开展传染病实验室检测、诊断、病原学鉴定；
（五）实施免疫规划，负责预防性生物制品的使用管理；
（六）开展健康教育、咨询，普及传染病防治知识；
（七）指导、培训下级疾病预防控制机构及其工作人员开展传染病监测工作；
（八）开展传染病防治应用性研究和卫生评价，提供技术咨询。国家、省级疾病预防控制机构负责对传染病发生、流行以及分布进行监测，对重大传染病流行趋势进行预测，提出预防控制对策，参与并指导对暴发的疫情进行调查处理，开展传染病病原学鉴定，建立检测质量控制体系，开展应用性研究和卫生评价。设区的市和县级疾病预防控制机构负责传染病预防控制规划、方案的落实，组织实施免疫、消毒、控制病媒生物的危害，普及传染病防治知识，负责本地区疫情和突发公共卫生事件监测、报告，开展流行病学调查和常见病原微生物检测。
衍生问题：
上海市港澳通行证办理流程是什么？
1、内地居民因私往来香港或澳门特别行政区旅游、探亲、从事商务、培训、就业等非公务活动，向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的往来港澳通行证及有效签注前往。
2、内地居民前往香港或澳门特别行政区定居，向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的前往港澳通行证前往。前往香港特别行政区定居的，持证人须于罗湖口岸、深圳湾口岸出境;前往澳门特别行政区定居的，持证人须于珠海拱北口岸出境。港澳通行证俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。来港澳前，必须取得内地公安部门签发有关来港澳目的签注(如团队旅游、个人旅游、商务或其他签注等)。往来港澳通行证有效期5年，签注分为探亲签注、商务签注、团队旅游签注、个人旅游签注、其他签注和逗留签注。持证人须在往来港澳通行证和签注有效期内，按照规定的次数和停留时限往来香港或者澳门。
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