办理环保工程总承包资质是要申请的，具体申请条件如下：环保工程专业承包企业资质分为一级、二级、三级。以三级资质标准为例：三级资质标准：
1、企业近5年承担过单机容量5万千瓦以上火电机组燃煤烟气脱硫工程，或以下6项中的4项以上工程施工，工程质量合格。
（1）单池容积100立方米以上的禽、畜粪便沼气池工程；
（2）单池容积200立方米以上的厌氧生化处理池工程；
（3）一般工业项目的噪声、有害气体、粉尘、污水、工业废料的综合处理工程；
（4）10吨以上工业及集中供热燃煤锅炉烟气脱硫工程；
（5）一等乙级以上等级医院医疗污水处理工程；
（6）单项合同额300万元以上的环保工程。
2、企业经理具有5年以上从事工程管理工作经历；技术负责人具有5年以上从事施工技术管理工作经历并具有本专业中级以上职称；财务负责人具有初级以上会计职称。企业有职称的工程技术人员不少于15人，其中具有中级以上职称的人员不少于5人，相关专业工程技术人员不少于3人。企业具有的三级资质以上项目经理不少于5人。
3、企业注册资本金100万元以上，企业净资产120万元以上。
4、企业近3年最高年工程结算收入300万元以上。
5、企业具有与承包工程范围相适应的施工机械和质量检测设备。三级企业承包工程范围:可承担单项合同额不超过企业注册资本金5倍的下列工程的施工：
1、单池容积300立方米及以下禽、畜粪便沼气工程；单池容积400立方米及以下厌氧生化处理池工程；
2、单机容量20万千瓦及以下火电机组燃煤烟气脱硫工程；20吨及以下工业及集中供热燃煤锅炉烟气脱硫工程；
3、小型工业项目噪声、有害气体、粉尘、污水、工业废料的综合处理工程；
4、一等甲级及以下等级医院医疗污水处理工程。环境工程设计资质标准：甲级
1、资历与信誉
（1）具有独立企业法人资格。
（2）社会信誉良好，注册资本不少于300万元人民币。
（3）企业独立设计过所申请专项类别大型环境工程项目不少于1项，或中型环境工程项目不少于3项。工程竣工并通过环境保护行政主管部门组织的验收。
2、技术条件
（1）专业配备齐全、合理，主要专业技术人员专业和数量符合所申请专项资质标准中“主要专业技术人员配备表”的规定。
（2）企业主要技术负责人应具有大学本科以上学历，5年以上从事环境工程设计经历，且主持过大型环境工程设计项目不少于2项，具备注册执业资格（限一级）或高级专业技术职称。
（3）在主要专业技术人员配备表规定的人员中，非注册人员应当作为专业技术负责人主持过所申请专项类别大型环境工程设计项目不少于1项，或中型环境工程设计项目不少于2项，具备中级以上专业技术职称。
3、技术装备和管理水平
（1）具有完善的工程计算机辅助设计系统，有固定的工作场所。
（2）企业管理组织机构、档案管理体系健全，建立了完善的质量保证体系，已通过ISO9000族质量标准体系认证，并有效运行。