工厂扣押员工身份证是违法的。
工厂或任何单位和个人无权扣押员工的身份证，身份证是公民个人的重要身份证明文件，不得非法占有。如果工厂扣押员工身份证，员工可以向公安机关报案或向劳动监察部门投诉，寻求法律援助。这种行为侵犯了公民的个人权利，违反了相关法律规定，工厂及其负责人可能会面临法律责任。
身份证的法律规定：
1、身份证的作用：身份证是公民合法身份的证明，用于个人身份的核实和证明；
2、身份证的管理：由公安机关负责身份证的申领、换发、补发及注销等管理工作；
3、身份证的携带：公民应当随身携带身份证，以便于必要时出示；
4、身份证的非法使用：任何组织和个人不得非法收集、使用、泄露他人身份证信息；
5、身份证的扣押禁止：任何单位和个人不得扣押他人身份证。
综上所述，工厂扣押员工身份证属于违法行为，侵犯了员工的个人权利，违反了法律规定，员工有权向公安或劳动监察部门投诉并寻求法律援助，而工厂及其负责人则可能因此承担相应的法律责任。
【法律依据】：
《中华人民共和国劳动合同法》
第八十四条
用人单位违反本法规定，扣押劳动者居民身份证等证件的，由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并依照有关法律规定给予处罚。用人单位违反本法规定，以担保或者其他名义向劳动者收取财物的，由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并以每人五百元以上二千元以下的标准处以罚款；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。劳动者依法解除或者终止劳动合同，用人单位扣押劳动者档案或者其他物品的，依照前款规定处罚。