铜山区征地补偿标准是由铜山区所在的市人民政府土地行政主管部门制定。根据《征地补偿标准》第十一条的规定，征收土地方案由市人民政府土地行政主管部门按照国家有关规定拟订，经依法批准后；市人民政府应当将批准征地机关、批准文号、征收土地位置、用途、范围、面积以及征地补偿登记的地点和期限等，在被征收土地所在地的乡（镇、办事处）和村、组予以公告，并组织实施。