胎儿为什么会发生先天性心脏病？有多少原因可以引起先天性心脏病？应该说到目前为止还没有搞清楚。现在已经知道在怀孕的第3-8周是胎儿心脏发育和形成的阶段，这个时期若有任何异常因素影响了心脏的发育，就有可能引起先天性心脏病，现在已经知道的有以下几个方面：
1、母亲在妊娠早期的感染，特别是病毒感染，可以影响胎儿心脏的发育，引起先天性心脏病，如比较肯定的是母亲在妊娠的头三个月以内患风疹，可以引起胎儿的先天性心脏病，还可伴有其他畸形。母亲孕早期的感冒，特别是伴有发热的感冒，即有病毒血症的感冒，也和先天性心脏病有关。
2、母亲在怀孕早期受外界有害因素的影响，发生染色体的畸变，也可引起先天性心脏病，如21—三体综合征时常伴有室间隔缺损。
3、遗传因素，有人观察到，某些先天性心脏病病人的家庭中，先天性心脏病儿的再出现率明显地比没有先天性心脏病的家庭多，因此考虑到和遗传因素有关系。
4、其他还有母亲孕期的用药，母亲孕期的疾病等，都与先天性心脏病的发生有关，此外还有一些原因尚不清楚。