首先，毕业证上的学校名称会有所不同，分别标注为西南石油大学南充校区和西南石油大学成都校区。这是因为毕业证上通常会明确标明学生所在的具体校区。
其次，校区所在的城市不同，南充校区位于南充市，而成都校区位于四川省省会成都市。因此，两个校区的校园环境、生活氛围以及城市发展等方面可能存在差异。
然而，无论在哪个校区就读，学校颁发的毕业证都是合法有效的，都代表着完成了相应的学业要求。学校的教学质量和学术声誉是整个学校的共同品牌，不会因为校区的不同而有本质上的差别。