有传染病不能办理健康证。
办理健康证时，必须通过体检，体检项目包括乙肝、内科检查、粪便检测等。体检合格者参加卫生知识培训。若体检发现传染病，将不能获得健康证。患有传染病的人士需治愈病情并通过体检后方可办理。
传染病的分类：
1、按传播途径分类：飞沫传播如流感；接触传播如疥疮；血液传播如艾滋病；
2、按病原体类型分类：细菌性如肺结核；病毒性如乙肝；寄生虫性如疟疾；
3、按发病速度和持续时间分类：急性传染病如流行性感冒；慢性传染病如乙型肝炎；
4、按传染性强弱分类：高度传染病如麻疹；低度传染病如疥疮；
5、按疾病严重程度分类：重大传染病如艾滋病；一般传染病如流行性腮腺炎。
综上所述，办理健康证需通过包括乙肝、内科检查和粪便检测在内的体检，并参加卫生知识培训，但若体检中发现传染病，则无法获得健康证，直至患者治愈并通过相应的体检程序。
【法律依据】：
《中华人民共和国食品安全法》
第四十五条
食品生产经营者应当建立并执行从业人员健康管理制度。患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员，不得从事接触直接入口食品的工作。从事接触直接入口食品工作的食品生产经营人员应当每年进行健康检查，取得健康证明后方可上岗工作。
《预防性健康检查管理办法》
第十四条
卫生监督机构根据健康检查结果，对预防性健康检查合格者签发健康合格证明。对不合格者提出处理意见并监督执行。原始材料同时交受检单位或规定的存档单位存档。
《餐饮服务食品安全监督管理办法》
第十条
餐饮服务提供者应当按照《食品安全法》第三十四条的规定，建立并执行从业人员健康管理制度，建立从业人员健康档案。餐饮服务从业人员应当依照《食品安全法》第三十四条第二款的规定每年进行健康检查，取得健康合格证明后方可参加工作。
从事直接入口食品工作的人员患有《食品安全法实施条例》第二十三条规定的有碍食品安全疾病的，应当将其调整到其他不影响食品安全的工作岗位。