公司组织结构的不合理可能会导致以下问题：
沟通障碍：如果公司组织结构不合理，部门之间的沟通可能会受阻，信息无法流通，影响决策的准确性和及时性。
决策困难：不合理的组织结构可能导致决策者无法获取全面的信息和资源，难以做出正确的决策。
工作效率低下：部门之间的协调不畅、重复劳动、资源浪费等问题会导致工作效率低下。
员工士气低落：不合理的组织结构可能导致员工感到不公平，工作动力和士气会受到影响。
创新能力下降：创新通常需要不同部门之间的交流和合作，如果组织结构不合理，将会限制创新的发生。
为了解决组织结构不合理可能带来的问题，管理者可以采取以下方法：
重新设计组织结构：根据公司的发展阶段和业务需求，重新设计组织结构，确保各部门之间的协作和信息流畅。
强化沟通机制：建立有效的沟通机制，促进部门之间的信息共享和交流，减少沟通障碍。
建立跨部门团队：设立跨部门团队推动项目的跨部门合作，提高工作效率和创新能力。
提升员工参与感：鼓励员工参与组织决策，增强员工的归属感和责任感，提升工作积极性。
定期评估和调整：定期评估组织结构的有效性，根据反馈意见和实际情况进行必要的调整和改进。
举例来说，某公司在扩大业务后，组织结构没有相应调整，导致销售部门和生产部门之间的协作不畅，信息传递不及时，影响了产品的及时生产和交付，最终影响了客户满意度和公司的盈利能力。经过重新设计组织结构，建立销售与生产部门的协作机制，公司的生产效率和客户满意度得到了提升。
综上所述，合理的组织结构对于公司的运作至关重要，管理者应认识到不合理组织结构可能带来的问题，并及时采取措施加以解决。