区别如下：
1、参保人群不同。城镇居民医疗保险面向的群体为所有未参加职工医疗保险的群体，上至老人，下至幼儿，而职工医疗保险面向的群体主要为有工作单位的职工，以及灵活就业人员。
2、参保地不同。大部分地区的居民医疗保险只能在户籍地参加，而职工医保是随着参保单位的变更而改变的，如果是灵活就业人员，那么也只能在户籍所在地参保。
3、缴费方式不同。城镇居民医疗保险的缴费是按年缴纳的，每年9月至12月为居民医疗保险的集中缴费时间，只有缴费后，次年才可以享受城镇居民医疗保障待遇；职工医疗保险费用是按月缴纳的，每月缴费根据职工社保缴费基数，以及医疗保险的缴费比例来确定，职工的医疗保险费用由单位和职工个人共同承担。
4、缴费年限要求不同。城镇居民医疗保险没有设置最低缴费年限要求，如果要享受城镇居民医疗保障待遇，那么必须每年都参加城镇居民医疗保险，而职工医疗保险设置的有最低缴费年限要求。
不同地区关于职工医疗保险最低缴费年限要求规定不同，通常男性需要缴费满30年，女性满25年，当职工医疗保险缴费年限达到最低年限要求后，就可以享受终生医疗保障待遇。
5、待遇标准不同。居民医疗保险和职工医疗保险相比较，保障待遇总体要比职工医保低一些。并且居民医疗保险没有个人医保账户，而职工医疗保险有个人医保账户，每月个人缴费划入到职工个人医保账户当中，参保人员可以在药店买药、医院消费使用。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》第四条中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
第二十三条职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。