扁桃体是人体的免疫器官，具有抗病毒、抗细菌的防御功能。但咽喉是饮食和呼吸空气的通道，通常容易隐藏病菌和异物，一般情况下不会发病。
但如果人体的免疫力低下，就容易使患者出现扁桃体反复发炎、发烧的症状，尤其好发于免疫力较差的婴幼儿。
治疗不彻底
对于扁桃体而言，大部分医生会采取抗生素治疗，但有些人会认为服用太多抗生素对身体不好，尤其是小孩，害怕影响小孩的生长发育，因此当扁桃体症状消失后，就立即停用抗生，其实这个时候，扁桃体发炎还没有完全治愈，从而导致扁桃体发炎、发烧反复发作的情况。
气候变化
扁桃体发炎之所以反反复复，还与季节更替和气候变化有关，这种情况好发于小孩，因为大多数小孩不会及时的增添衣物，而气温的突然下降和升高，再加上小孩好动出汗，容易诱发感冒，导致扁桃体发炎、反复发烧的现象。
其他因素
除了上述因素容易引起扁桃体发炎，反复发烧以外，长期劳累、烟酒过度或患有某些慢性疾病，都可能成为扁桃体发炎，反复发烧的因素之一。
扁桃体发炎反复发烧要不要切除扁桃体
扁桃体发炎反复发烧是否需要切除扁桃体需要根据患者自身情况而定，一般来说下面的情况可以考虑切除扁桃体：
1.扁桃体炎反复发作，每年大于4次以上的患者，甚至有扁桃体周围脓肿的病史。
2.扁桃体过度肥大，已经妨碍了正常的吞咽、呼吸、尤其是出现营养障碍或明显打鼾的患者。
3.风湿热、关节炎、风心病是扁桃体发炎的并发症，所以有上述并发症的扁桃体发炎患者应该切除扁桃体。
4.因为扁桃体肥大，影响了咽鼓管功能，从而造成慢性渗出性中耳炎，并且经过保守治疗没有效果的患者。
5.不明原因出现长期低热，全身检查时，除了扁桃体发炎无其他病变的患者。
6.扁桃体出现良性肿瘤，甚至是出现恶性肿瘤的患者。