公积金5%与12%的最大区别就是，需要上缴的金额不同。公积金是根据个人月工资的一定比例来上缴的，比例越高，需要交上去的钱就越多，而且不同的比例对公积金今后的收益也会有很大的影响。在连续上缴公积金，满足了办理公积金住房贷款的条件时，个人上缴公积金的时间长短与额度高低，就决定了贷款金额的多少。
缴存基数
职工住房公积金月缴存基数=职工上年工资总额÷12
缴存计算
职工住房公积金月缴存额=职工个人住房公积金月缴存额+单位资助住房公积金月缴存额
职工个人住房公积金月缴存额=职工住房公积金月缴存基数×职工住房公积金缴存比例
单位资助住房公积金月缴存额=职工住房公积金月缴存基数×单位住房公积金缴存比例
缴存基数中的工资总额计算口径以国家统计局发布的《关于工资总额组成的规定》(统制字[1990]1号文)为依据，应包括：计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班工资、特殊情况下支付的工资，新参加工作或新调入职工当年缴存基数为职工本人首月工资总额。
缴存比例是公司自己定的，缴存公积金要确定两个数据，一是缴存基数(一般指基本工资)，二是缴存比例(一个百分比，最高12%，最低一般是5%，以1%为单位来累进)，缴存比例分单位比例和个人比例，公司的比例是全单位统一的，个人比例一般与公司的比例相同，但也可以个别人申请调高些，但不能低于公司的比例数。比如你的基本工资(缴存基数)为2000，公司及个人的缴存比例都是10%，不考虑社保个税什么的话，那每个月，你领到手的工资就只有1800，有10%是在发工资前缴存到了你的公积金帐户里，而同时你的单位也要缴存200元到你的公积金帐户，所以你实际上的收入是2200，但可以自由支配的钱就只有1800，公积金里的400元要因为买楼或租房等原因才能申请出来用。