二类经济适用房和满5年的一类经济适用房出售与普通住宅出售流程一致，其价格也可以按市场价出售。
二类经济适用房则要交一笔计税价格×3%的土地出让金。
需要注意的是，二类经济适用房经过交易房屋性质就变为商品房，其税费缴纳比例就会按照商品房买卖税费缴纳标准执行。
如果实在想要出卖未满5年的一类经济适用房，卖方应当向户口所在区县住房保障管理部门提出申请，由区县住房保障管理部门通过摇号等方式确定新的符合条件的购房人(购房人须按照有关规定，已办理经济适用住房的购买资格审核手续)，由买方按原价购买或由区县住房保障管理部门按原价回购。
(1)按原价出售住房的
a.卖房向户口所在区县住房保障管理部门提交书面申请，并提供原购房合同、房屋产权证、身份证、户口本等材料。
b.区县住房保障管理部门通过摇号等方式确定购房人。购房人放弃购买的，由区县住房保障管理部门确定后续的购房人。
c.购房人查验房屋和相关资料后，与产权人签订购房合同，支付购房款。区县住房保障管理部门登记买卖双方信息，出具相关证明。
d.买卖双方持购房合同、区县住房保障管理部门出具的证明以及其他相关材料，向区县房屋权属登记部门申请办理房屋转移登记手续。房屋权属登记部门将房屋产权登记在购房人名下，并在房屋权属证书上注记"经济适用住房"字样。
(2)区县住房保障管理部门按原价回购的
a.卖方向户口所在区县住房保障管理部门提交书面申请，并提供原购房合同、房屋产权证、身份证、户口本等材料。
b.区县住房保障管理部门对申请材料进行审核并入户查看，了解房屋状况，确认卖方结清水、电、气、热和物业管理等费用。
c.区县住房保障管理部门或其指定单位与卖方签订回购协议，支付购房款。
d.区县房屋权属登记部门凭回购协议及其他相关材料办理房屋转移登记手续，将回购房屋的产权登记在区县住房保障管理部门或其指定单位名下，并在房屋权属证书上注记"经济适用住房"字样。